Baburova bắt đầu hoạt động chính trị khi cô chứng kiến bọn Tân Quốc xã tấn công một người nước ngoài, sau đó cô đã viết trong nhật ký: "Thật khó khăn khi nhìn vào mắt của một sinh viên Hàn Quốc, người vừa mới bị 2 tên côn đồ vị thành niên đâm trong đền thờ... chúng vẫy tay 'Sieg Heil' hướng tới xe điện và chạy đi".

Baburova hoạt động trong phong trào bảo vệ môi trường vô chính phủ. Cô từng tham gia các hoạt động của các trại sinh thái, trong các diễn đàn xã hội, trong đó có Diễn đàn Xã hội châu Âu lần thứ 5 ở Malmö (Thụy Điển) năm 2008, tổ chức lễ hội "Chống chủ nghĩa tư bản" năm 2008, và đã tham gia các hoạt động chống phát xít nói chung.

Tháng 7 năm 2008, Baburova đã tham gia một cuộc biểu tình chống việc chặt rừng Khimkinsky. Cô đã phải ngủ một đêm trong nhà tù vì tham gia một cuộc phản đối chống lại việc đuổi các cựu công nhân nhà máy thịt heo "Smena" ở Moskva và các người nhập cư từ Cộng đồng các Quốc gia Độc lập (CIS) bi bần cùng hóa.

Ngày trước khi bị giết, Baburova xuất hiện trong cuộc họp những người cộng sản vô chính phủ của tổ chức "Autonomous Action". Trước đó cô đã viết một bài nhân danh báo "Avtonom"